Schlussstein der Bioinformatik: Big Data in der Biologie

Beschreibung

In diesem Kurs lernen Sie, wie Sie die von Illumina (unserem Industriepartner) entwickelte Cloud-Plattform BaseSpace nutzen, um verschiedene Standardansätze der Bioinformatik-Software auf echte biologische Daten anzuwenden.

In einer Reihe von Anwendungsherausforderungen wird insbesondere gezeigt, wie die Genomassemblierung verwendet werden kann, um die Quelle eines Lebensmittelvergiftungsausbruchs zu verfolgen, wie RNA-Sequenzierung uns dabei helfen kann, Genexpressionsdaten auf Gewebeebene zu analysieren und die Vor- und Nachteile davon zu vergleichen Sequenzierung des gesamten Genoms vs. des gesamten Exoms zum Auffinden potenziell schädlicher Mutationen in einer menschlichen Probe.

Darüber hinaus haben Studenten des Hacker-Tracks die Möglichkeit, ihren eigenen Genom-Assembler zu erstellen und ihn auf echte Daten anzuwenden!