Metagenomik zur Überwachung von Krankheitserregern und Antibiotikaresistenz Das Universitätsnetzwerk

Beschreibung

Das Gebiet der Metagenomik und der Sequenzierung der gesamten Gemeinschaft ist ein vielversprechender Bereich, um den Inhalt mikrobieller Gemeinschaften und ihre Beziehung zu Krankheiten und Antibiotikaresistenzen in der menschlichen Bevölkerung zu entschlüsseln. Bioinformatische Instrumente sind äußerst wichtig, um aus Metagenomikdaten einen Sinn zu machen, indem das Vorhandensein von Krankheitserregern und Determinanten der Antibiotikaresistenz in komplexen Proben abgeschätzt wird. In Kombination mit relevanten erklärenden Daten ist die Metagenomik ein leistungsstarkes Instrument zur Überwachung.

In diesem Kurs unterrichten wir über das Potenzial der Metagenomik zur Überwachung und geben den Lernenden einen Überblick über die Schritte und Überlegungen in einer Metagenomik-Studie. Nach diesem Kurs wissen die Lernenden:

- der Unterschied zwischen den Konzepten der Metagenomik und anderer mikrobieller Genomik
- die Notwendigkeit, Kontrollen in verschiedenen Schritten einer Metagenomik-Studie zu verwenden
- die Vorteile der Metagenomik für die Überwachung der Antibiotikaresistenz
- wie Stichprobenentwurf, Stichprobengröße, Probenmaterial und Probenhandhabung das Ergebnis einer Metagenomik-Studie beeinflussen
- Probenverarbeitung für die bakterielle und virale Metagenomik
- verschiedene Sequenzierungsplattformen und ihre Möglichkeiten in Bezug auf Metagenomik
- die Schritte einer allgemeinen Metagenomik-Studie, einschließlich Qualitätskontrolle, Zuordnung zu verschiedenen Datenbanken und Lesezählungsanalyse
- die Prinzipien hinter verschiedenen Tools zur Analyse von Metagenomikdaten
- wie man die Ergebnisse der Leseklassifizierung interpretiert
- die Notwendigkeit einer Epidemiologie bei der Überwachung
- das Konzept der globalen und integrierten Überwachung
- die Herausforderungen für den Einsatz von Metagenomik in der Überwachung
- das Potenzial der Metagenomik zur Überwachung

Wir freuen uns darauf sie begrüßen zu dürfen !