Spezialisierung auf pflanzenbioinformatische Methoden

Beschreibung

Die letzten 15 Jahre waren spannend in der Pflanzenbiologie. Hunderte von Pflanzengenomen wurden sequenziert, RNA-seq ermöglichte ein transkriptomweites Expressionsprofil und eine Proliferation von "-seq" -basierten Methoden ermöglichte die kostengünstige Bestimmung von Protein-Protein- und Protein-DNA-Wechselwirkungen mit hohem Durchsatz Weise. Diese Datensätze ermöglichen es uns wiederum, Hypothesen per Mausklick oder Fingertipp zu erstellen. Die Plant Bioinformatics Specialization auf Coursera führt die wichtigsten bioinformatischen Kompetenzen und Ressourcen ein, wie z. B. Genbank, Blast, Mehrfachsequenz-Alignments und Phylogenetik von NCBI in Bioinformatic Methods I, gefolgt von Protein-Protein-Wechselwirkung, struktureller Bioinformatik und RNA-Sequenzanalyse in bioinformatischen Methoden II. In Plant Bioinformatics decken wir 33 pflanzenspezifische Online-Tools ab, von Genombrowsern über transkriptomisches Data Mining bis hin zu Promotor- / Netzwerkanalysen und anderen. Schließlich verwendet ein Capstone für Pflanzenbioinformatik diese Werkzeuge, um eine biologische Rolle für ein Gen mit unbekannter Funktion zu vermuten, die in einem schriftlichen Laborbericht zusammengefasst ist. Diese Spezialisierung ist für jeden modernen Pflanzenmolekularbiologen nützlich, der ein Gefühl für den unglaublichen Umfang der verfügbaren Daten bekommen möchte an Forscher. Ein kleiner Teil der R-Programmierung wird in Bioinformatic Methods II eingeführt, aber die meisten Tools sind Webanwendungen. Es wird empfohlen, dass Sie Zugriff auf einen Laptop oder Desktop-Computer haben, um diese auszuführen, da diese möglicherweise nicht als mobile Anwendungen auf Ihrem Telefon oder Tablet funktionieren.